LNMP一键安装包安装的MySQL默认是开启了日志文件的，如果数据操作比较频繁就会产生大量的日志，在/usr/local/mysql/var/下面产生mysql-bin.0000* 类似的文件，而且一般都在几十MB到几个GB，更甚会吃掉整个硬盘空间，从来导致mysql无法启动或报错。
如何关闭MySQL的日志功能：
删除日志：
执行：/usr/local/mysql/bin/mysql -u root -p
输入密码登录后再执行：reset master;
回车后再输入：quit 退出mysql命令模式。
彻底禁用MySQL日志：修改/etc/my.cnf 文件，找到
log-bin=mysql-bin
binlog_format=mixed
再这两行前面加上#，将其注释掉，再执行/etc/init.d/mysql restart即可。
如果实在想保留日志，可以在/etc/my.cnf里[mysqld]部分中加入expire_logs_days = 10 然后重启mysql，这样10天就会自动清理日志。
本文以LNMP一件安装包安装的环境为例除MySQL重启命令和配置文件路径可能略有不同，其他一样。
如果VPS或服务器上一点空间都没有启动不了的话可以mysql-bin.0000*删除，然后清空mysql-bin.index文件里的内容，再重启mysql，这样虽然也可以清理日志，但是有一定的分析，如采用此方法建议先备份日志及数据库文件。
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引用：
http://www.vpser.net/manage/delete-mysql-mysql-bin-0000-logs.html